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腐殖酸螯合肥是自然形成的腐殖酸，按照其生成过程，通常有以下两种：
土壤腐殖酸：现代动植物残体掩埋在土壤中，受土壤微生物作用，经过分解、裂变、合成等一系列生化反应后形成的腐殖酸。
煤炭系腐殖酸：一类是古代动植物的遗体因地壳运动被埋在地下深处，长期受地壳压力和地热作用发生变质炭化，但停留在形成煤炭之前形成的腐殖酸，如褐煤中的腐殖酸；另一类是形成煤炭后，再次裸露在地面，受阳光雨雪风化后形成，通常与风化煤一起产生。
再生腐殖酸
再生腐殖酸是将煤炭系腐殖酸的褐煤或风化煤，用强酸或强碱进行氧化反应制成。如用硝酸制成的硝基腐殖酸，腐殖酸螯合肥用硫酸或盐酸分解制成的磺基腐殖酸和氯基腐殖酸，或者用混酸分解制成的混合再生腐殖酸。
腐殖酸肥料的作用之一：腐殖酸螯合肥改善土壤团粒结构
腐殖酸可以起到粘结剂的作用，将其周围的粘土矿物离子黏附在一起形成团粒结构。其过程是先将几个粘土矿物离子黏附结合成微团粒，然后数个微团粒再黏附成大团粒，一些大团粒再相互黏结形成巨大的土壤团粒。腐殖酸螯合肥这样的团粒结构具有一定的耐水性，不易因土壤水分过多而溃散，因此，在保持土壤团粒结构上具有重要作用。我们知道，团粒结构是土壤保水、保肥必不可少的条件之一。
